Pendant la Seconde Guerre mondiale, l'abbé résistant Henri Kremer se voit mystérieusement libéré du camp de concentration de Dachau. À son arrivée au Luxembourg, il apprend que les nazis, sous couvert de lui permettre de rendre hommage à sa mère récemment décédée, lui accordent neuf jours pour convaincre son évêque d'abandonner sa politique d'opposition face au régime, sans quoi il sera renvoyé à Dachau.

Sous la France occupée de 1942, à Paris, Edmond Batignole, un boucher sans histoire, tente de survivre comme tant d'autres. Il peut se laisser entraîner par son entourage et sa lâcheté sur les pentes de l'infamie. Mais il va choisir de lutter pour sauver la vie de Simon, un petit enfant juif.

Sous le régime de Vichy, alors que les dirigeants parlementent, la vie de simples citoyens est bouleversée et la Résistance s'organise.

Jeff Tuche, se réjouit de l’arrivée du TGV dans son cher village. Malheureusement, le train à grande vitesse ne fait que passer, sans s’arrêter à Bouzolles. Déçu, il tente de joindre le président de la République pour que son village ne reste pas isolé du reste du territoire. Sans réponse de l’Élysée, Jeff ne voit plus qu’une seule solution pour se faire entendre : se présenter à l’élection présidentielle...

A Paris, le 3 mars 1942, sous l'Occupation allemande, deux hommes voient leurs destins se croiser et s'entremêler. D'un côté, Jean-Devaivre, un assistant-metteur en scène, trouve le moyen de camoufler ses activités clandestines de résistant en travaillant pour la Continental, une firme cinématographique allemande dirigée par le Docteur Greven et qui produit des films français depuis 1940. De l'autre, Jean Aurenche, un scénariste-poète, refuse de travailler pour les Allemands et s'engage par la plume dans une lutte héroïque contre l'envahisseur nazi.

Jeanne est une jeune femme séductrice et sensuelle. Amoureuse de son cousin, prêtre, qu'elle entraine dans une débauche incestueuse, elle court de proie en proie: Pierre, professeur qu'elle entraine en Suède, paradis de l'amour libre en ces années 70, pour le perdre; Prevost et sa femme, la fragile Clara, qu'elle charmera dans une cabine du Night Ferry entre Paris et Londres; un guitariste qui se suicidera pour elle... Mais les flammes l'attendent, comme son modèle, le vrai Dom Juan.

Andréa, pilote de ligne aguerrie, est prise dans une tempête aussi soudaine que violente lors d'un vol de routine et réussit de justesse à sauver les passagers de son avion. Elle est malgré tout suspendue de ses fonctions, sa hiérarchie ne croyant pas à l'urgence de la situation. Révoltée, elle part dans les Alpes, sur les conseils d'un météorologue, enquêter sur ces phénomènes soudains appelés “super-cellules”. Là-bas elle rencontre deux frères pilotes et vont tous les trois se retrouver au coeur du danger.