Paris, juste avant la Première Guerre mondiale. André Toulon, qui dirige un atelier de poupées et de marionnettes, est fou amoureux d'une femme, qui est en danger pour avoir été témoin d'un meurtre. Un jour, un sorcier égyptien sur son lit de mort apprend une formule à Toulon, qui permet de donner vie aux objets inanimés. Toulon va se servir de cette formule pour donner vie à ses propres poupées, qu'il a nommées les Puppet Masters. Il va s'en servir pour sauver la femme qu'il aime.

Le docteur Lorca, un excentrique collectionneur de curiosités biologiques, vient juste d’acquérir son plus précieux spécimen : les restes d'un horrible mutant issu de substances toxiques que son propriétaire a d’ailleurs l’intention de récupérer. Cependant la querelle qui s’est engagée entre les deux hommes est rapidement interrompue lorsque l’immonde créature revient à la vie en réanimant toute une armée de petits monstres féroces. Plusieurs agents du FBI sont également sur le coup...